Na dworcach, ulicach, w autobusach, sklepach i szpitalach istnieje niewidzialny świat, o którym nauka wciąż wie niewiele. Międzynarodowy zespół badaczy przeanalizował blisko 3 tys. próbek ze 102 miast w 31 krajach i stworzył pierwszy atlas wirusów RNA występujących w środowisku miejskim. Wyniki zaskakują – spośród niemal 55 tys. wykrytych wirusów aż 77 proc. nie było wcześniej znanych nauce. W globalnym badaniu uczestniczył również Kraków.
Tysiące próbek z miejsc, które mijamy każdego dnia
Materiał do analiz pochodził z dworców, środków komunikacji miejskiej, szpitali, banków, sklepów, ulic, terenów zielonych, gleby oraz ścieków. Próbki z miast uczestniczących w projekcie global City Sampling Day były zbierane od marca do lipca 2020 roku pod koordynacją konsorcjum MetaSUB, a następnie połączono je z materiałami środowiskowymi pochodzącymi z innych projektów badawczych. Efektem prac międzynarodowego zespołu z udziałem obecnych i byłych naukowców Małopolskiego Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego jest publikacja w czasopiśmie „Nature Communications” oraz pierwsze tak obszerne opracowanie pokazujące różnorodność wirusów RNA obecnych w przestrzeni miejskiej.
Większości wykrytych wirusów nauka wcześniej nie znała
Badacze zidentyfikowali niemal 55 tys. wirusów RNA, z których około 77 proc. nie było wcześniej opisanych. Analiza pozwoliła również wyróżnić dwie potencjalnie nowe gromady oraz nową klasę wirusów RNA, co znacząco rozszerza dotychczasową wiedzę o ich różnorodności. W przypadku wirusów, którym udało się przypisać gospodarza, ponad połowę stanowiły prawdopodobnie bakteriofagi, czyli wirusy atakujące bakterie. Naukowcy wykryli także 166 wirusów RNA powiązanych z czterema bakteriami należącymi do grupy ESKAPE, obejmującej sześć szczególnie groźnych patogenów szpitalnych: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa oraz Enterobacter spp.
Krakowskie próbki trafiły do światowej analizy
Kraków uczestniczy w międzynarodowej akcji konsorcjum MetaSUB od 2020 roku, dzięki staraniom dr. hab. inż. Pawła Łabaja, prof. UJ. Próbki ze stolicy Małopolski zostały pobrane przy współpracy z Urzędem Miasta Krakowa oraz miejskimi jednostkami, a następnie włączone do globalnego zbioru danych. Udział miasta w projekcie pozwolił porównać jego mikrobiom z materiałami pochodzącymi z dziesiątek metropolii na świecie i stał się częścią badań, których celem jest poznawanie mikroorganizmów występujących w przestrzeni publicznej oraz obserwowanie zmian mogących mieć znaczenie dla zdrowia mieszkańców.
Atlas może ostrzegać przed nowymi zagrożeniami
Autorzy badania wskazują, że regularne sprawdzanie wirusów RNA obecnych w miejskim środowisku może w przyszłości stać się częścią systemu wczesnego ostrzegania przed nowymi zagrożeniami epidemiologicznymi. Systematyczne pobieranie i porównywanie próbek pozwalałoby wychwytywać pojawienie się nieznanych wcześniej wirusów oraz śledzić zmiany zachodzące w mikrobiomie miast. Opublikowany atlas jest pierwszym krokiem do stworzenia takiego narzędzia i pokazuje, jak wiele nieopisanych dotąd organizmów znajduje się w miejscach, z których każdego dnia korzystają tysiące ludzi.
Dziękujemy, że przeczytałeś nasz artykuł do końca. W Kurierze Krakowskim każdego dnia piszemy o najważniejszych wydarzeniach z Krakowa i Małopolski.
Bądź na bieżąco! Obserwuj, komentuj i udostępniaj. Odwiedź nas także na Facebooku i YouTubie.
Masz temat? Napisz do nas: kontakt@kk24.info
